明代の万暦２２年。
中国では、天下統一のための戦乱が各地で吹き荒れていた。
さらに、豊臣秀吉の迫害から逃れた織田家の残党が中国に渡り、
日月教を宗派とする｢苗族｣と結託したことによって、争いの火種は領土を拡大し、
日中入り乱れての争いとなっていた。

ところが苗族に内乱が生じ、その隙を狙って｢東方不敗｣が彼らを支配するようになる。
そのため、強大な勢力を誇っていた日月教も衰弱し、教主は投獄され、
代表者たちは東方不敗の配下に置かれることとなった。

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その頃、乱世に嫌気がさし隠遁生活を送っていた剣士リン(李連杰)は、
妹弟子であるツァイツァイと共に、日月教の本部へと向かっていた。
｢１年後に会おう｣と、同門の剣士たちと約束をしていたのである。

旅の途中、リンは妖艶な美女と出会い、酒を酌み交わす。
だが彼女は、リンが目を離した隙に姿を消してしまっていた。
後ろ髪を引かれる思いを抱えつつ、リンは目的地である本部へと向かうのだった。

ところが、リン達が本部に辿り着いた頃には既に教主は投獄され、
東方不敗の支配に逆らう者達も、命の危機にさらされながら逃げ暮らしていた。
また、教主の娘であるイン(ロザムンド・クァン)が東方不敗に囚われていることを知る。
リンは彼女と教主を救うため、仲間たちを引き連れて東方不敗の領地へと忍び込んだ。

すると、なぜかこの場所で、いつかの美女と再会したのだ。
２人は月夜に照らされた丘へと出かけ、とりとめのない話をし、更に仲を深めることとなった。

続々と東方不敗に寝返っていった、かつての弟子たち。
中でも一番弟子として大切に可愛がっていた者が、誰よりも最初に教団を裏切ったことを知った
教主は冷静さを失い、復讐の鬼と化していた。

教主はリンと仲間たちに対し、裏切り者と東方不敗を始末し、この世を一緒に統治しないかと
持ちかけるが、剣を捨てることを決意していたリン達は、これを断った。
そして、このことが更に教主を激昂させることになり、リン達までもが戦いの標的にされてしまう。

教主の娘インは、想い人でもあるリンを救おうと、こっそり逃がしてくれることになった。
先にひとりで教団を出発することになったリンは、いつかの美女を思い出し、
彼女の元を訪れることにした。

そして、東方不敗が身代わりにとあてがった別の女だとは知らぬまま、リンは女と肌を重ね合わせる。

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その頃、東方不敗は日月教の本部を攻撃していた。
宿屋は破壊され、教団の者たちは次々と命を奪われ、リンの仲間達までもが皆殺しにされていた。

女との戯れのあと、眠りについていたリンは、異変に気づいて目を覚ます。
そして、教団の宿屋のあたりが燃えているのを見て、急いで彼らの元へと戻った。

大切な仲間たちの命までもが奪われたことを知ったリンは、一度捨てる決意をした剣に
再び手を伸ばす。そして、教主と共に東方不敗を打倒することを心に誓った。

教主・教主の娘イン・妹弟子のツァイツァイと共に、リンは東方不敗の元へと向かった。
ところが、そこにいたのは紛れもなく例の美女だった。

東方不敗は、最強の力を得ることができるという｢葵花宝典｣の秘伝により、
男性であることを捨てていたのだった。この事実を知り、戸惑うリン。
｢あの夜の相手は本当に君だったのか？｣と問うも、東方不敗は何も答えない。
そして、リンの放った一撃で大きな痛手を負った東方不敗は、自ら崖へと身を投げたのだった。劇終。